I krebssyklusen blir karbonatomer fra acetylgruppen spaltet av som karbondioksid i to av trinnene i syklusen. Koenzym A avgir ikke pyruvat til syklusen: det er acetylgruppen fra pyruvat, dannet i en overgangsreaksjon før krebssyklusen, som bindes til koenzym A og føres inn i syklusen som acetyl-CoA. Energibærerne som dannes i krebssyklusen, er NADH og $\mathrm{F}\mathrm{A}\mathrm{D}{\mathrm{H}}_2$, ikke NADPH, i tillegg til at det dannes noe ATP/GTP direkte. Oksygengass brukes ikke i selve krebssyklusen, men lenger ut i elektrontransportkjeden.