Temperatur. Calvinsyklusen styres av enzymer, for eksempel rubisko. Enzymaktiviteten avhenger av temperaturen. Er temperaturen ulik i glassene, kan forskjeller i opptaket skyldes temperaturen og ikke innholdet eller lysbehandlingen.

Mengden kloroplaster. Flere kloroplaster gir flere enzymer, og da tas mer karbondioksid opp. Alle glassene må derfor ha like mye kloroplastmateriale, og like mye karbondioksid tilgjengelig ved start.

Andre faktorer som bør være like: pH, volum, forsøkstid, og lysintensitet og bølgelengde i glassene som står i lys.

Karbondioksid tas opp i glass 1, 2 og 5.

Lysreaksjonene skjer i tylakoidmembranene. Der brukes lysenergi til å lage $\mathrm{ATP}$ og $\mathrm{NADPH}$. Calvinsyklusen skjer i stroma. Den bruker $\mathrm{ATP}$ og $\mathrm{NADPH}$ til å binde $\mathrm{C}{\mathrm{O}}_2$ og lage sukker. Calvinsyklusen trenger ikke lys direkte, bare $\mathrm{ATP}$ og $\mathrm{NADPH}$.

• Glass 1: Hele kloroplaster i lys. Lysreaksjonene gir $\mathrm{ATP}$ og $\mathrm{NADPH}$, og calvinsyklusen tar opp $\mathrm{C}{\mathrm{O}}_2$.
• Glass 2 og 5: Tylakoidene mangler, men $\mathrm{ATP}$ og $\mathrm{NADPH}$ er tilsatt. Enzymene i stroma kan da binde $\mathrm{C}{\mathrm{O}}_2$, både i lys og i mørke.
• Glass 3 og 6: Uten tylakoider skjer ingen lysreaksjoner. Da dannes verken $\mathrm{ATP}$ eller $\mathrm{NADPH}$, og $\mathrm{C}{\mathrm{O}}_2$ tas ikke opp.
• Glass 4: Hele kloroplaster, men i mørke skjer ingen lysreaksjoner. Calvinsyklusen stopper når lageret av $\mathrm{ATP}$ og $\mathrm{NADPH}$ er brukt opp.