I slektskapstreet er Denisova og Neandertal søstergrupper – de to grenene deler det nyeste felles forgreiningspunktet og har dermed en felles stamfar nærmere i tid enn noen av de andre gruppene. Neandertal er derfor gruppen som er mest i slekt med Denisova-gruppen, uavhengig av hvor mye DNA som senere er overført mellom gruppene ved krysning.